T를 이용한 유전자 편집의 규제

Feb 15, 2024

자연식물(2023)이 기사 인용

측정항목 세부정보

Agrobacterium tumefaciens를 통한 형질전환은 외인성 DNA를 식물 게놈에 도입하는 데 사용되는 주요 방법입니다1,2. Agrobacterium에서 유래한 전달 DNA(T-DNA)는 단일 복사본으로 통합되거나 복잡하게 연결된 형태로 통합될 수 있지만 최종 T-DNA 구조에 영향을 미치는 메커니즘은 아직 알려지지 않았습니다. 여기서 우리는 T-DNA에 RT(레트로트랜스포존) 유래 서열을 포함시키면 Arabidopsis thaliana에서 T-DNA 사본 수를 50배 이상 증가시킬 수 있음을 보여줍니다. 이러한 추가 T-DNA 사본은 큰 연쇄체로 구성되며, 이는 비-LTR DNA 반복을 사용하여 복제할 수 있는 RT의 긴 말단 반복(LTR)에 의해 주로 유도되는 효과입니다. 우리는 T-DNA 연결이 DNA 복구 단백질 MRE11, RAD17 및 ATR의 활성에 의존한다는 것을 발견했습니다. 마지막으로, 우리는 T-DNA 연결을 사용하여 표적 돌연변이 유발 및 유전자 표적화의 빈도를 높일 수 있음을 보여줍니다. 전반적으로, 이 연구는 애기장대에서 T-DNA 사본 수를 조절하는 분자 결정인자를 밝히고 식물 유전자 편집을 위한 T-DNA 연결 유도의 유용성을 보여줍니다.

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본 연구에서 생성된 데이터는 주요 그림, 확장 데이터 및 보충 정보에 포함되어 있습니다. 원시 시퀀싱 데이터는 NCBI SRA(BioProject PRJNA892619)에 보관됩니다. TAIR10 Arabidopsis 게놈(https://www.arabidopsis.org/download/index-auto.jsp%3Fdir%3D%252Fdownload _files%252FGenes%252FTAIR10_genome_release)과 'Orthologous gene family' 목록을 활용한 데이터 분석 Dicots PLAZA 5.0 데이터베이스(https://ftp.psb.ugent.be/pub/plaza/plaza_public_dicots_05/GeneFamilies/genefamily_data.ORTHOFAM.csv.gz)에서 가져왔습니다. 데이터 가용성에는 제한이 없습니다. 이 문서에는 원본 데이터가 제공됩니다.

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